În aprilie 2012, actrița a început să se întâlnească cu guvernatorul Chiapas, Manuel Velasco Coello. Doi ani mai târziu, cei doi s-au logodit în luna octombrie și au decis să se căsătorească la 25 aprilie 2015 într-o ceremonie religioasă privată desfășurată la San Cristóbal de las Casas. Au doi fii: Manuel, născut pe 17 ianuarie 2017 și Emiliano, născut pe 2 februarie 2020.

Cel de-al doilea băieţel al familiei a venit pe lume pe 2 februarie, luând pe toată lumea prin surprindere. Anahi era însărcinată în 37 de săptămâni şi credea că va mai dura puţin până când va veni momentul să nască, însă bebeluşul a decis să se grăbească şi să se nască pe o dată specială, 02.02.2020. ''Bine ai venit pe lume, Emiliano! S-a grăbit puţin. 37 de săptămâni. Slavă Domnului suntem amândoi bine. A fost o naştere frumoasă, dar o să vă povestesc cu altă ocazie totul cu detalii. Acum vrea doar să-i mulţumesc din tot sufletul Lui Dumnezeu, dar şi vouă pentru că v-aţi rugat pentru noi şi ne-aţi transmis atât de multă dragoste'', a scris Anahi pe Instagram.